S ciljem rasta i razvoja sporta i povečanja kvalitete nogometa u Istri, NK Istra 1961 potpisala je suradnju sa mnoglim Istarskim klubovima.

Trenutno je suradnja sklopljena sa 9 Istarskih klubova a to su:

NK VIŠNJAN

NK KAŠTELIR LABINCI

NK DINAMO MARIJA NA KRASU

 

NK BUZET

 

NK TAR

NK PETROVIJA

 

NK FUNTANA

 

NK ARNE-PERUŠKI

 

NK DAJLA

 

NK LIŽNJAN

 

NK MUNTIĆ

 

NK MARČANA

 

NK ISTRA PULA

 

NK ULJANIK

 

NK MLADOST FAŽANA

 

NK MEDULIN

 

NK GRBCI

 

ŠN VRATARI ISTRE