S ciljem rasta i razvoja sporta i povečanja kvalitete nogometa u Istri, NK Istra 1961 potpisala je suradnju sa mnoglim Istarskim klubovima.

Trenutno je suradnja sklopljena sa 9 Istarskih klubova a to su:

NK VIŠNJAN

NK KAŠTELIR LABINCI

NK DINAMO MARIJA NA KRASU

 

NK BUZET

 

NK TAR

NK PETROVIJA

 

NK FUNTANA

 

NK ARNE-PERUŠKI

 

NK DAJLA